系统解析：根据Everyone except Tom and John可知这里except的意思是除了, 后面谓语动词的选用要看except前面的主语, 本句中except前面的主语是everyone, 它作主语的时候谓语动词应该用单数形式, 再根据when the meeting began, 这里句子使用的是一般过去时, 所以前面的句子的时态也应该用一般过去时, 这里be动词的一般过去时的单数形式是was. 故选D.
【翻译】
当会议开始的时候, 除了Tom和John没来, 每个人都在这.
